俞北平(陈建斌 饰)携夫人徐咏仪(李煜 饰)刚刚抵达清城，便被告知在清城大学上学的女儿徐丹妮(朱颜曼滋 饰)被捕。徐丹妮一心反抗自己的特务家庭，在一次抓捕行动中掩护共产党曹旭东，最棘手的是，曹旭东恰好是“约翰案”涉案的关键人物之一。 俞北平亲自审讯徐丹妮，徐丹妮任性倔强，拒不合作，父女俩僵持不下。 “约翰案”初步得出结论，系共产党所为，目标是约翰手中的绝密文件《攻防部署》，但案件仍疑点重重。清城特调局内部同样乱作一团，“约翰案”锁定的5名嫌疑人均来自特调局，目前5人已被监控，局内人心涣散，各自打算，派系斗争激烈。尤以局长吴昆才(曹卫宇 饰)老奸巨猾，阳奉阴违，深谙人事斗争，这令俞北平在清城的工作举步维艰。 就在清城一团乱麻时，郑翊(俞飞鸿 饰)根据张瀚民的线索继续追踪，发现了识破俞北平身份的重要证据。郑翊制定了一份假《攻防部署》准备带到清城，等待俞北平上钩。